Guide de démarrage avec /

Comment déplacer le modèle ?

• Pour faire pivoter le modèle, il suffit simplement de placer le curseur de la souris sur le cadre J(S)mol et de le faire glisser (déplacer la souris tout en maintenant un clique gauche).
  • Ainsi, le modèle tourne autour de l'axe X (horizontal) et de l'axe Y (vertical) ; si vous avez besoin de le faire tourner autour de l'axe Z (perpendiculaire à l'écran), maintenez la touche Maj enfoncée tout en maintenant un clique gauche et en faisant glisser horizontalement le curseur de la souris.
• Pour déplacer le modèle dans le cadre, maintenez la touche Ctrl enfoncée tout en maintenant un clique droit et en faisant glisser le curseur de la souris.

Comment redimensionner le modèle ?

• Pour agrandir le modèle, en changeant sa taille apparente, cliquez sur le cadre J(S)mol, puis utilisez la molette de la souris, ou maintenez la touche Maj enfoncée tout en faisant glisser verticalement le curseur.
  • Vous pouvez ouvrir une copie du modèle dans une nouvelle fenêtre séparée (plus grande et redimensionnable), en utilisant l'icône (sur la barre de menu supérieur du cadre J(S)mol).

Affichage du modèle moléculaire

• Vous disposez des icônes (bâtonnets), (boules et bâtonnets) et (sphères) situés dans la barre de menu supérieur du cadre J(S)mol.
• Accessible par un simple clique droit sur le cadre du modèle 3D, vous pouvez également utiliser le menu J(S)mol, avec plus d'options Style > Combinaison, Style > Atomes y Style > Liens.

Comment mesurer les distances et les angles du modèle ?

• Pour mesurer une distance (par exemple, la longueur d'une liaison) double-cliquez sur un atome ; lorsque vous déplacez le curseur une ligne en pointillée apparaît, et lorsque vous poursuivez le déplacement sur un second atome la distance s’affiche. Si vous double cliquez sur le second atome, la mesure sera affichée en permanence.
• Pour mesurer un angle double-cliquez sur un atome ; déplacez le curseur sur un deuxième atome sur lequel vous faites un simple clic ; puis poursuivez le déplacement jusqu'à un troisième atome : l'angle s'affiche. Si vous double-cliquez sur le troisième atome, la mesure sera affichée en permanence.
• Pour mesurer un angle dièdre ou angle de torsion, double-cliquez sur un atome ; déplacez le curseur sur un deuxième atome sur lequel vous faites un simple clic ; puis poursuivez le déplacement jusqu'à un troisième atome sur lequel vous faites à nouveau un simple clic ; enfin, terminez en choisissant un déplacement vers un quatrième et dernier atome : l'angle dièdre s'affiche. Si vous double-cliquez sur le quatrième atome, la mesure sera affichée en permanence.
• Les mesures effectuées peuvent être masquées, affichées à nouveau, supprimées définitivement ou consultées en utilisant la section « Mesures » du menu J(S)mol.

Vous disposez également d'une aide plus complète pour l'utilisation de J(S)mol avec la souris.