B.1.1.529 le variant omicron

Omicron, le nouveau variant du SARS-CoV-2, virus responsable de la Covid-19, compte 53 mutations, dont 34 sur sa protéine de pointe (dite protéine spike ou S).

Ce variant émergeant d’Afrique-du-Sud et du Botswana inquiète, car la protéine de pointe (ou protéine S) joue un rôle déterminant pour la contagiosité du virus et pour l’efficacité des vaccins.

Depuis le début de la pandémie, face aux précédents variants (alpha, bêta, gamma, delta) jugés également préoccupants, les vaccins se sont révélés aussi efficaces, ou légèrement moins efficaces, mais jamais inefficaces. Qu’en sera-t-il pour Omicron ?

Nous vous proposons un bref éclairage scientifique sur ce nouveau variant omicron.

La structure du SARS-CoV-2

Responsable de la Covid-19, le virus SARS-CoV-2 observé au microscope électronique.

*Source :* Pr Agnès Gautheret-Dejean, 2020.

Le rôle déterminant de la protéine virale Spike

Vision moléculaire de la **protéine Spike.** *Source :* Univ. du Texas à Austin/Jason McLellan.

Déterminant pour la contamination

C’est par la protéine de pointe (Spike) que le virus se connecte aux récepteurs des cellules humaines et les infecte.

À ce jour, nous savons que les mutations sur cette protéine du variant omicron rendent le virus plus contagieux.

**Schéma illustrant l’interaction entre le SARS-CoV-2 et le récepteur ACE2 présent à la surface des cellules cibles du coronavirus.** Le RBD (receptor binding domain) est le domaine de liaison au récepteur. Il s’agit d’une région cruciale de la protéine spike (spicule) dans la mesure où c’est elle qui se lie au récepteur ACE2, plus précisément par l’intermédiaire d’un motif appelé RBM (receptor binding motif). Saxena SK, et al. Virusdisease. 2020 Dec 5;31(4):1-9.

Déterminant pour les vaccins

Les vaccins apprennent au corps à fabriquer les protéines de pointe du virus pour que les anticorps les reconnaissent en cas d’infection et neutralisent le virus.

Les protéines de pointe d’Omicron pourraient avoir tellement muté que les anticorps ne les reconnaîtraient pas. Ce n’est cependant jamais arrivé avec les précédents variants.

Le rôle de la protéine virale Spike pour les vaccins

Durée de la vidéo : 1 minute 57 secondes
Date de publication : le 29 juillet 2021
Production : Vaccine Makers Project
Description : « How COVID-19 mRNA Vaccines Work ? » – Comment fonctionnent les vaccins à ARNm contre la Covid-19 ? – Version originale sous-titrée en français.
Hébergement : la chaîne YouTube Vaccine Makers Project

Comparaison du variant omicron avec les autres souches du virus alors en circulation

Alpha	Bêta	Gamma	Delta	Omicron
Émergence : Royaume-Uni	Émergence : Afrique-du-Sud	Émergence : Brésil	Émergence : Inde	Émergence : Afrique-du-Sud et Botswana
Mutations : 22 (9 sur la pointe)	Mutations : 18 (8 sur la pointe)	Mutations : 23 (12 sur la pointe)	Mutations : 22 (9 sur la pointe)	Mutations : 53 (34 sur la pointe)
Contagiosité : 1,6 x plus	Contagiosité : 1,5 x plus	Contagiosité : 2,2 x plus	Contagiosité : 1,5 x plus	Contagiosité :
Virulence : 1,4 x plus	Virulence : 3,6 x plus	Virulence : 2,6 x plus	Virulence : 1,9 x plus	Virulence :

Virulence = intensité de la maladie. Contagiosité = potentiel de transmission.

Les variants Delta et Omicron

Les données préliminaires sur le variant omicron

Durée de la vidéo : 3 minutes 57 secondes
Date de publication : le 27 novembre 2021
Auteur : Thibault Fiolet
Description : variant Omicron (B.1.1.529) identifié en Afrique du Sud et Botswana : les données préliminaires. Que sait-on sur ce variant classé préoccupant par l’OMS ?
Hébergement : la chaîne YouTube Quoidansmonassiette

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